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功能基因的谱系多样性：宏基因组学新视角
编号：8
稿件编号：66 访问权限：仅限参会人
更新：2024-04-10 15:31:25 浏览：555次
口头报告
报告开始：2024年04月13日 15:55 （Asia/Shanghai）
报告时间：20min
所在会议：[一] 专题一：地质微生物学研究新理论、新技术与新方法 » [1] 专题一：地质微生物学研究新理论、新技术与新方法
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摘要
我们开发了REMIRGE流程，从鸟枪法宏基因组测序读数中重建全长功能基因，并充分探索了冷泉沉积物中关键基因的系统发育多样性。结果表明，参与甲烷、硫和氮循环的功能基因的丰度和多样性在非冷泉点和5个冷泉点存在差异。在海马冷泉的CS位点，我们观察到沉积物在厘米尺度上存在功能类群的分异，其中表层可能是微生物物种和功能的储库。此外，我们还发现相关基因的特定基因序列簇之间存在正相关，表明耦合发生在特定功能类群之间。总的来说，REMIRGE揭示了深海冷泉微生物功能群的代谢通路偏好和系统发育多样性，这是常规方法无法检测到的。
关键字
宏基因组,功能基因,功能基因多样性,功能耦合,新方法建立
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