氨氧化古菌（AOA）是全球生境中无处不在的典型化学自养菌，在全球氮碳循环中发挥重要作用。盐沼作为海岸带的主要类型之一，其潮间带含水层是元素循环的热点区域。近年来，研究人员广泛研究了海岸带AOA的多样性、组成和驱动因素，但对于缺氧潮间带含水层中AOA的系统发育多样性、生态位和代谢潜力的研究仍然不足。针对此问题，本研究利用来自盐城湿地盐沼潮间带的宏基因组样本重建了32个AOA基因组。基于系统发育分析我们发现了一个新的在潮间带含水层广泛分布的AOA属，并命名为Candidatus Nitrosomaritimum（候选亚硝化海滨菌属）。该属与在海岸带中占主导地位的Nitrosopumilus属的丰度相当，基于氨单加氧酶基因全球数据集的进一步分析表明该属在全球的河口-海岸带环境和海洋沉积物中广泛存在。该属包含适应缺氧含水层环境的独特亚系，盐度和溶解氧梯度环境驱动了该生境下不同亚系的共存。比较基因组学分析表明Nitrosomaritimum具有尿素利用潜力并且携带Phn磷酸盐转运系统（phnCDE）用于磷酸盐摄取，同时还携带假定的氧化亚氮还原酶基因（nosZ）用于氧化亚氮还原。此外，该研究还首次在潮间带重建了热液古菌（Hydrothermarchaeota）的基因组，其携带羟胺氧化还原酶基因，用于共存AOA释放的胞外羟胺的合作代谢和解毒作用。总的来说，该研究揭示了海岸带未知AOA谱系在全球氮循环中被忽视的重要作用，为海岸带AOA的环境监测和管理以及氮素污染控制提供了重要的科学依据。

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