微生物地理学旨在研究微生物在不同地理空间中的分布模式，关注它们的群落结构、生态功能和演化过程如何受到生态或地理因子的影响。目前的微生物地理学研究大多基于扩增子测序和生物多样性数据，推测微生物群落整体的分布模式，抑或基于纯培养菌株的基因组数据，推测特定物种的分布模式以及相关的环境驱动因素。但现有方法难以同时分析环境中多个物种的地理分布模式，并比较不同区域或不同物种之间的地理分布差异和环境驱动因素。本研究结合群体遗传学理论和高通量宏基因组测序数据，开发新的研究方法，可以大批量重构多个物种的地理分布模式。本研究将该方法应用于青藏高原湖泊环境，发现不同区域的湖泊微生物具有差异化的地理分布模式：高原中部的羌塘区域地势平坦，容易在全球变暖时期发生流域重组事件，这打破了不同湖泊之间的地理隔离，促进了微生物的遗传交流效率；而高原南部的雅鲁藏布区域遍布崇山峻岭，不同湖泊长期维持相对隔离的状态，微生物的地理分布模式更为明显。微生物地理学研究可以揭示微生物演化与环境选择、地质事件之间的相互关系，能够为地质事件的覆盖范围和发生时间提供微生物水平的证据，为地质微生物的后续探索提供新的研究思路。

微生物地理分布,青藏高原湖泊,中性遗传多样性